يمكن تقسيم السموم الفطرية من حيث تأثيرها علي صحة الإنسان والحيوان إلى ثلاثة مجاميع رئيسية:
- مجموعة السموم التي تتعامل مع الجهاز الهضمي:
ويكون أغلب تأثيرها علي الكبد وهي تضم نسبة كبيرة من السموم الفطرية وأهمها مجموعة الأفلاتوكسين.
- مجموعة السموم التي تتعامل مع الجهاز البولي:
وخاصةً الكلى وأهمها الأوكراتوكسين.
- مجموعة السموم التي تتعامل مع الجهاز التناسلي:
ولها تأثير أستروجيني ومنها الزيرالينون ومشتقاته والترايكوسيثين.
