أدى ذلك المناخ العلمي والفكري الملائم وازدهار العلم الطبي الذي عاش ابن البيطار في كنفه إلى نبوغه العلمي، الأمر الذي يبدو في المؤلفات العديدة التي تركها.
ومن أهم هذه المؤلفات:
1- كتاب ميزان الطب.
2- كتاب شرح أدوية ديسقوريدس.
3- كتاب الأفعال الغريبة والخواص العجيبة.
4- كتاب المغني في الأدوية المفردة.
5- كتاب الجامع في الأدوية المفردة.
